Radovi objavljeni na projektu 1-03-018

• Rad u časopisu 1
  
• Doktorska dizertacija 1
  
• Magistarski rad 2
  
• Mentorstvo 2
  

1. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Non-homogeneous kinetics in the competition of single-stranded calf-thymus DNA and low-molecular weight scavengers: Comparison of experimental data and theoretical models.
   

   Autori:

   Udovičić, Ljiljana (24971)

   Mark, Franz

   Bothe, Eberhard

   Schulte-Frohlinde, Ditrich

   Časopis: Int. J. Radiat. Biol.
   Broj: 3
   Volumen: 59
   Godina: 1991
   Stranice: od 677 do 697
   Broj referenci: 32
   Jezik: engleski
   Sažetak: Mjeren je prinos jednostrukih lomova što ih u jednostrukoj DNA u vodenoj otopini natopljenoj s N2O/O2 prouzroči Co gama zračenje,u ovisnosti o concentraciji dodanih presretača za OH radikale.Relativan odnos jednostrukih lomova u odnosu na OH radikalemjeren je i u režimu impulsne radiolize. Obadva režima dovode dou osnovi iste ovisnosti o kapacitetu presretanja. Kod najvišegupotrijebljenog presretačkog kapaciteta (oko 10 exp 9 s-1) stvarase oko 8 puta više lomova nego što predviđa jednostavna homogenakinetika. Eksperimentalni podaci su uspoređeni s teorijskimmodelima zasnovanim na nehomogenoj kinetici, koji uključuju itragove i izravni efekt zračenja. Uasporedba pokazuje da seradijacijski prinos jednostrukih lomova u ovisnosti opresretačkom kapacitetu može kvantitativno objasniti bezempirijske prilagodbe parametara, ako se za DNA uzme model valjkapolumjera R = 0.80 nm, koji na svojoj površini reagira s OHradikalima difuzijski kontroliranom brzinom. Raspravljeni sučinioci koji mogu utjecati na ovisnost jednostrukih lomova uovisnosti o presretačkom kapacitetu. Porast prividne brzinereakcije pri povišenju presretačkog kapaciteta objašnjava sepromjenom prosječnog dosega difuzije OH radikala u otopini. Datesu procjene udjela nasumičnih OH radikala, OH radikala iz tragovai izravnog efekta.
   Ključne riječi: Nehomogena kinetika, OH radikali, jednostruki lomovi u DNA
   

   ---

2. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Long-range hole migration in irradiated crystals of nucleic acid bases. An EPR study
   

   Autori:

   Herak, Janko N. (15541)

   Huttermann, Jurgen

   Časopis: Int. J. Radiat. Biol.
   Broj: 3
   Volumen: 60
   Godina: 1991
   Stranice: od 423 do 432
   Broj referenci: 28
   Jezik: engleski
   Sažetak: U ozračenim polikristaliničnim uzorcima nekoliko baza nukleinskihkiselina, kokristaliziranih s malim količinama molekulatioanalogona, EPR spektroskopijom pretraživani su radikali snesparenim elektronom na sumporu. U bezvodnom citozinu, citozinmonohidratu i citozin hidrokloridu a 0.01 - 1% tiocitozinaopaženi su jaki signali S-radikala, drugačijih spektroskopskihznačajki od onih za čisti tiocitozin. Slično tome, u guaninu sprimjesama tioguanina (0.1 - 1%) opaženi su jaki signali povezanis tioguaninom. Nasuprot tome, u sistemu timin-tiotimin nisuzamijećeni spektri svojstveni S-radikalima. Isto tako, ne opažajuse S-radikali niti u sistemima s inkompatibilnim bazama ianalogonima (citozin-tioguanin ili guanin - tiocitozin), kao ni uuzorcima u obliku smrznutih otopina ili stakala, niti u većiniuzoraka pripremnjenih "freeze-dry" tehnikom. Rezultati suprodiskutirani sa stajališta migracije šupljina na velikerazdaljine.
   Ključne riječi: baze nukleinskih kiselina, EPR, migracija šupljina, slobodni radikali, tioanalogoni baza
   

   ---

3. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Postirradiation long-range energy transfer in a single crystal of cytosine monohydrate: an EPR study
   

   Autori:

   Sanković, Krešimir (28635)

   Herak, Janko N. (15541)

   Časopis: Radiat. Res.
   Volumen: 128
   Godina: 1991
   Stranice: od 119 do 124
   Broj referenci: 16
   Jezik: engleski
   Sažetak: Tiocitisin inkorporiran u kristalnu rešetku citozin monohidrataponaša s kao stupica za elektrone i šupljine. Zračenjem stvoreniion- radikali otpuštaju svoj naboj zagrijavanjem. Suvišnielektroni i šupljine putuju rešetkom na velike razdaljine.Migracija šupljina dokazana je akumuliranjem kationskihtiocitozin radikala termiškom aktivacijom nakon ozračavanja.Migracija elektrona dokazana je formiranje S-radikala anionskeprirode. Procijenjeno je da je doseg migracije šupljina barem 30međumolekulskih razmaka, a doseg elektrona 100 međumolekulskihrazmaka. Selektivno formiranje kationskih i anionskih radidala natiocitozinu, ovisno o koncentraciji stupica, objašnjeno jerazlišitim migracijskim svojstvima elektrona i šupljina.
   Ključne riječi: Citozin monohidrat, EPR, prijenos elektrona, prijenos šupljina, radijacijsko oštećenje
   

   ---

4. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: EPR evidence for the oxidation-induced formation of negatively charged species on the low-density lipoprotein surface
   

   Autori:

   Brnjas-Kraljević, Jasminka

   Pifat, Greta

   Herak, Janko N. (15541)

   Jurgens, Gunther

   Časopis: Free Rad. Res. Comm.
   Broj: 5
   Volumen: 14
   Godina: 1991
   Stranice: od 307 do 313
   Broj referenci: 21
   Jezik: engleski
   Sažetak: Povećanje rezultantnog naboja na površini LDL čeatica proučavanoje elektroforetskom pokretnošću i EPR spektroskopijom. Povećanjenegativnog naboja povezano je ne samo neutralizacijom lizinskihskupina na apoproteinu B nego i izlaganjem dodatnih negativnonabijenih skupina na površinu LDL-a. Povećanje broja negativnonabijenih čestica na površini objašnjava se konformacijskompromjenom apoproteina B, neutralizacojom lizinskih skupina icijepanjem peptidnih veza. Moguće je i da reaktivni radikalikisika pretvore histidin u aspartičnu kiselinu i prolin uglutaminsku kiselinu.
   Ključne riječi: EPR, LDL lipoprotein, ionsko vezanje, oksidacija lipoproteina, elektroforetska pokretnost
   

   ---

5. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: The yield of single-strand breaks in double-stranded calf-thymus DNA as a function of OH scavenger concentration: Comparison of experimental data and theoretical results based on nonhomogeneous reaction kinetics
   

   Autori:

   Udovičić ., Ljiljana (24971)

   Bothe, Eberhard

   Mark, Franz

   Schulte-Frohlinde, Ditrich

   Časopis: Period. Biol.
   Broj: 2
   Volumen: 92
   Godina: 1991
   Stranice: od 339 do 340
   Broj referenci: 7
   Jezik: engleski
   Sažetak: Mjereni su radijacijom izazvani jednostruki lomovi dvonitne DNA.Pokazano je, da se radijacijski prinos jednostrukih lomova možedobro interpretirati modelom za nehomogenu kinetiku na površinivaljka, ber upotrebe ikakvih prilagodljivih parametara. Kod većihkoncentracija molekula-presretača oko 90% prinosa otpada nadjelovanje OH radikala, a samo oko 10% predstavlja izravni efektzračenja.
   Ključne riječi: Dvonitna DNA, jednostruki lomovi, nehomogena kinetika radijacijska oštećenja
   

   ---

6. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Oxidation hypothesis of atherogenesis
   

   Autori:

   Herak, Janko N. (15541)

   Časopis: Acta Pharm. Jugosl.
   Volumen: 41
   Godina: 1991
   Stranice: od 299 do 309
   Broj referenci: 66
   Jezik: engleski
   Sažetak: Noviji rezultati pokazuju da lipoproteini iz krvne plazme, posebno lipoproteini male gustoće (LDL) , mogu biti modificirani in vivo. Te modifikacije, najvjerojatnije uzrokovane oksidacijom, mogu utjecati na aterogenetska svojstva lipoproteina. U ovom su radu prikazane fizičko-kemijske promjene LDL-a uzrokovane modifikacijom, opisan je okoliš u arteriji gdje se zbiva oksidacija i određuje daljnja sudbina LDL-a i konačno, opisani su mogući oksidacijski procesi. Posebno je raspravljeno o mogućim procesima inicijacije oksidacije. Po prvi puta je ukazano da pored ili umjesto aktivnih specija kisika neke druge tvari koje se mogu naći u jezgri LDL-a, ovisno o ishrani ili okolišu, mogu biti inicijatori oksidacije.
   Ključne riječi: Aterogeneza, inicijacija oksidacije lipoproteina, LDL
   

   ---

7. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Spin traps initiate free radical formation in unsaturated fatty acids
   

   Autori:

   Herak-Kramberger, Carol Mirna (149081)

   Herak, Janko N. (15541)

   Krilov, Dubravka (23525)

   Časopis: Acta Pharm. Jugosl.
   Volumen: 41
   Godina: 1991
   Stranice: od 345 do 350
   Broj referenci: 16
   Jezik: engleski
   Sažetak: U uzorcima nezasićenih masnih kiselina inkubiranih sa spinskim stupicama stvaraju se termički aktivirani slobodni radikali. Za stvaranje radikala nisu potrebni peroksidi ili molekularni kisik. U uzorcima bez prisutnosti kisika opažaju se čisti lipidni spinski produkti. U uzorcima s kisikom najprije se opažaju uhvaćeni oksi radikali. Zaključujemo da spinske stupice ne samo hvataju i stabiliziraju već stvorene radikale, nego također sudjeluju u stvaranju radikala reakcijom s nezasićenim masnim kiselinama.
   Ključne riječi: EPR, nezasićene masne kiseline, oksidacija lipida, slobodni radikali
   

   ---

8. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Low frequency vibrational spectra of cytosine monohydrate single crystals
   

   Autori:

   Kirin, Davor

   Weber, Igor

   Časopis: J. Molec. Structure
   Volumen: 267
   Godina: 1992
   Stranice: od 67 do 72
   Broj referenci: 12
   Jezik: engleski
   Sažetak: Na monokristalu citozin monohidrata mjereno je Ramanovoraspršenje na frekvencijama ispod 400 cm-1. Opažene su tri novevibracijske vrpce, koje su pripisane translacijskim modovimavode. Provedeni su računi normalnih koordinata u aproksimacijikrutog tijela. Za atom-atom potencijale uzete su u obzir i Vander Waalsove interakcije i vodikove veze. Raspravljen je utjecajmreže vodikovih veza na dinamiku kristalne rešetke. Ukazano je namogući utjecaj ovih saznanja na ponašanje molekule DNA
   Ključne riječi: Citozin monohidrat, vibracijski modovi vode, Ramanmovo raspršenje
   

   ---

9. Tip rada: Rad u časopisu
   

   Naslov: Chemical modification of low-density liporpotein enhances the number of binding sites for divalent cations
   

   Autori:

   Pifat, Greta

   Brnjas-Kraljević, Jasminka

   Jurgens, Gunther

   Herak-Kramberger, Carol Mirna (149081)

   Herak, Janko N. (15541)

   Časopis: Chem. Phys. Lipids
   Volumen: 63
   Godina: 1992
   Stranice: od 159 do 167
   Broj referenci: 33
   Jezik: engleski
   Sažetak: Metoda EPR s paramagnetskim Mn(II) ionima upotrijebljena je zaispitivanje negativno nabijenih mjesta na površini modificiranihLDL čestica. Pet različitih modifikacija LDL-a prouzrokujepovećanje kapaciteta vezanja divalentnih kationa. Povećanovezanje povezano je s popvećanjem broja "jakih" veznih mjesta."Jaka" mjesta predstavljaju karboksilne skupine aspartične iglutaminske kiseline, a "slaba" mjesta su zwitter-ionskifosfolipidi. U nativnom LDL-u negativne skupine tvore "veze" spozitivnim lizinskim skupunama, time stabilizirajući strukturu.Svako deprotoniranje ili modifikacija lizinskih amino skupinadovodi do olabavljenja strukture LDL-a i do mogućnosti pristupakarboksilnim skupinama za divalentne katione.
   Ključne riječi: EPR, modificirani LDL, stabilizirana struktura LDL-a, vezanje Mn(II) iona
   

   ---

10. Tip rada: Rad u časopisu
    

    Naslov: Physical changes of low-density lipoprotein on oxidation
    

    Autori:

    Herak, Janko N. (15541)

    Časopis: Chem. Phys. Lipids
    Volumen: 66
    Godina: 1993
    Stranice: od 231 do 234
    Broj referenci: 28
    Jezik: engleski
    Sažetak: LDL iz ljudske krvne plazme oksidiran je na tri različita načina.Svi oksidirani uzorci pokazali su nižu temperaturu termotropskogprijelaza i niži udio helikoidalne strukture u apoproteinu B,nego nativni LDL. Opaženo je sniženje temperature termotropskogprijelaza za do 2 stupnja. To sniženje je kvalitativno objašnjenoporemetnjom molekulskog polja jezgre, uzrokovanom prisutnošćuprimjesa. Sničenje helikoidalnosti je drastično: u nekim uzorcimaudio helikoidalne strukture smanjen je i do 50%.
    Ključne riječi: Alfa-heličnost, CD, DSC, LDL, oksidacija, termotropski prijelaz
    

    ---

11. Tip rada: Rad u časopisu
    

    Naslov: Probing of the surface of high-density lipoproteins with Mn(II) ions and EPR spectroscopy
    

    Autori:

    Brnjas-Kraljević, Jasminka

    Pifat, Greta

    Herak, Janko (15541)

    Časopis: Croat. Chem. Acta
    Broj: 3
    Volumen: 66
    Godina: 1993
    Stranice: od 550 do 557
    Broj referenci: 12
    Jezik: engleski
    Sažetak: EPR spektroskopija s paramagnetskim ionima Mn(II) upotrijebljenaje za proučavanje negativno nabijenih skupina na površini dvajulipoproteina velike gustoće, HDL2 i HDL3, iz ljudske krvneplazme. Kao i za LDL, na površini LDL postoje dvije vrste veznihmjesta. Konstante vezanja mangana gotovo su jednake za dvijepodskupine HDL kao i za LDL. Mali broj "jakih" veznih mjesta(n1=2), koja se pripisuju negativno nabijenim aminokiselinamaupućuju na činjenicu da je od ukupnog broja negativno nabijenihaminokiselina u liporpoteinu samo malen broj dostupan za vezanjekationima. Konstante vezanja za "slaba" vezna mjesta i brojtakvih mjesta na tri uspoređena lipoproteina slažu se spretpostavkom da se "slaba" mjesta odnose na fosfolipidne domenena površini lipoproteina.
    Ključne riječi: EPR, HDL, površinska vezna mjesta, vezanje mjesta
    

    ---

12. Tip rada: Doktorska dizertacija
    

    Naslov: Radiation-induced DNA strand breaks in aqueous solution
    Fakultet: Prirodoslovno-matematički Sveučilište u Zagrebu
    Datum obrane: 15.10.91
    Jezik: engleski
    Broj stranica: 155
    Sažetak: Eksperimentalno i teorijski proučavani su lomovi lanaca DNA uvodenim otopinama. Radijacijski prinosi jednostrukih lomovalanaca eksperemintalno su mjereni mjerenjem molekularne maseprodukata raspršenjem svjetlosti pod malim kutom. Uzorci suozračavani pod raznim uvjetima, posebno varirajući koncentracijuOH radikala i molekula-presretača. Ovisnost brojajednostrukih lomova o primnjenoj dozi je linearna, a brojadvostrukih lomova je linearno-kvadratična. Eksperimentalnirezultati uspoređeni su s predviđanjima teorije na bazinehomogene reakcijske kinetike ca molekule cilindričnog oblika, bez prilagodbe ikakvih empirijskihparametara.. Teorija dobro predviđa ovisnost broja jednostrukihlomova o koncentraciji presretača u jednolančanoj i dvolančanojDNA. Računi pokazuju da i kod najvuiših koncentracija presretačaveći dio oštećenja potječe od indirektnog efekta. Pokazano je dau sistemima bez kisika sekundarni radikali povezani sapresretačima doprinose tvorbi jednostrukih lomova. Uoksigeniranim otopinama većina dvostrukih lomova potječe od OHradikala.
    Ključne riječi: DNA, dvostruki lomovi, jednostruki lomovi, nehomogena reakcijska kinetika, OH radikali, radijacijsko oštećenje
    

    ---

13. Tip rada: Magistarski rad
    

    Naslov: Molekulske interakcije u kristalima hidrata baza nukleinskih kiselina
    Fakultet: Prirodoslovno-matematički Sveučilište u Zagrebu
    Datum obrane: 01.01.91
    Jezik: hrvatski
    Broj stranica: 87
    Sažetak: Ramanovi spektri kristala citozin monohidrata (CMH) i njegovogdeuteriranog analoga snimljeni su u području ispod 400 cm-1.Opažene su tri do sada neregistrirane vrpce i pridruženetranslacijskim modovima vode. U računu dinamike kristalnerešetke, molekule citozina i vode opisane su u aproksimacijikrutog tijela. Molekulske interakcije opisane su pomoću atom-atompotencijala. U obzir su uzete Van der Waalsove i interakcijevodikove veze. Empirički podešene konstante sila opisuju petneekvivalentnih vodikovih mostova u kristalu. Raspravljena jeprikladnost ovog jednostavnog opisa polja sila, koje je opisano skompletnijim teorijskim modelima. Vlastiti su vektori fononskihmodova detaljno opisani. Istražen je utjecaj mreže vodikovih vezaposredovanih vodom na dinamiku kristala CMH-a. Istaknute suimplikacije ovog računa u vezi s modelima dinamike DNA.
    Ključne riječi: Aproksimacija krutog tijela, citozin monohidrat, Ramanovi spektri, vibracija wode
    

    ---

14. Tip rada: Magistarski rad
    

    Naslov: Dinamika oksidacije lipoproteina
    Fakultet: Prirodoslovno-matematički Sveučilište u Zagrebu
    Datum obrane: 21.12.94
    Jezik: hrvatski
    

    ---

15. Tip rada: Mentorstvo
    

    Naslov: Radiation-induced DNA strand breaks in aqueous solution
    Fakultet: Prirodoslovno-matematički Sveučilište u Zagrebu
    Mentor: HERAK JANKO
    Datum obrane: 15.10.91
    Broj stranica: 155
    Autor: Udovičić Dr. Ljiljana
    Rad: Doktorat
    

    ---

16. Tip rada: Mentorstvo
    

    Naslov: Dinamika oksidacije lipoproteina
    Fakultet: Prirodoslovno-matematički Sveučilište u Zagrebu
    Mentor: HERAK JANKO
    Datum obrane: 21.12.94
    Broj stranica: 84
    Autor: Ukrainczyk Mr. Tatjana
    Rad: Magisterij
    

    ---

Ministarstvo znanosti i tehnologije	Engleski jezik	Svibor početna stranica	Abecedni popis	Složeno po šifri projekta	Složeno po ustanovi projekta	Pretraživanje	Pomoć