SVIBOR - Radovi u CC - projekt broj: 1-03-171

MINISTARSTVO ZNANOSTI I TEHNOLOGIJE

Strossmayerov trg 4, HR - 10000 ZAGREB
tel.: (01) 459 44 44, faks: (01) 459 44 69
E-mail: ured@znanost.hr

SVIBOR - Prikupljanje podataka o projektima u RH

Radovi citirani u Current Contents na projektu 1-03-171

Broj radova citiranih u CC: 15
Broj ostalih radova: 15
Ukupno objavljenih radova: 30

Naslov: Sklonosti za sekundarnu strukturu proteina: ovisnost o steričkim međudjelovanjima srednjeg dosega

Autori:: Juretić, Davor (19290); Williams, Robert W.

Časopis: Journal of Mathematical Chemistry
ISSN: 0259-9791
Volumen: 8
Godina: 1991
Stranice: od 229 do 242
Broj referenci: 39
Jezik: engleski
Sažetak: Sklonost za strukturu uzvojnice ovisi o susjedima u primarnoj strukturi proteina. Susjedi većeg volumena ili veće površine dostupne vodi povećavaju sklonost centralne aminokiseline da zauzme strukturu alfa-uzvojnice.
Ključne riječi: Sekundarna struktura, proteini, steričke interakcije, sklonosti

Naslov: Određivanje položaja alfa-uzvojnica u topljivim i membranski vezanim proteinima

Autori:: Juretić, Davor (19290)

Časopis: Periodicum Biologorum
Broj: 2
ISSN: 0031-5362
Volumen: 93
Godina: 1991
Stranice: od 279 do 280
Broj referenci: 16
Jezik: engleski
Sažetak: Sklonosne funkcije za hidrofobnu okolinu u primarnoj strukturi dobro predviđaju položaj transmembranskih alfa-uzvojnica
Ključne riječi: Sklonosne funkcije, membranski proteini, hidrofobnost

Naslov: Oligomeri magainina reverzibilno smanjuju potencijal membrane u liposomima sa citokrom oksidazom

Autori:: Juretić, Davor (19290); Hendler, Richard, W.; Kamp, Frits; Caughey, Winslow, S.; Zasloff, Michael; Westerhoff, Hans, V.

Časopis: Biochemistry
ISSN: 0006-2960
Volumen: 33
Godina: 1994
Stranice: od 4562 do 4570
Broj referenci: 50
Jezik: engleski
Sažetak: Magainini disipiraju potencijal membrane i stimuliraju respiraciju liposoma sa ugrađenom citoktom c oksidazom.
Ključne riječi: Magainini, citokrom oksidaza, liposomi, potencijal membrane, kontrola respiracije

Naslov: Funkcionalni sinergizam magainina PGLa and magainina-2 u Escherichia coli, stanicama tumora i liposomima

Autori:: Westerhoff, Hans, V.; Zasloff, Michael; Rosner, Lee, J.; Hendler, Richard, W.; De Waal, Anthony; Vaz Gomes, Ana; Jongsma, Ans, P. M.; Riethorst, Albert; Juretić, Davor (19290)

Časopis: Eur. J. Biochem.
ISSN: 0014-2956
Volumen: 228
Godina: 1995
Stranice: od 257 do 264
Broj referenci: 53
Jezik: engleski
Sažetak: Dva razna magainina mnogo su aktivniji u svojim biološkim funkcijama kada se dodaju zajedno nego svaki napose.
Ključne riječi: Sinergija, magainini, antimikrobska aktivnost, tumorske stanice, Escherichia coli, liposomi, citokrom c oksidaza

Naslov: Kvaliteta predviđanja sekundarne strukture za prirodne aminokiseline u topljivim proteinima

Autori:: Juretić, Davor (19290); Lučić, Bono (184293); Trinajstić, Nenad (50450)

Časopis: J. Mol. Struct. - Theochem.
ISSN: 0166-1280
Volumen: 338
Godina: 1995
Stranice: od 43 do 50
Broj referenci: 43
Jezik: engleski
Sažetak: Kvaliteta predviđanja sekundarne strukture proteina je najbolja za prolin u konformaciji zavoja i najgora za prolin u regularnim sekundarnim strukturama.
Ključne riječi: Sekundarna struktura, parametri kvalitete predviđanja, prolin

Naslov: Novi QSPR prilaz fizikalno-kemijskim svojstvima alfa aminokiselina

Autori:: Lučić, Bono (184293); Nikolić, Sonja; Trinajstić, Nenad (50450); Juretić, Davor (19290); Jurić, Albin

Časopis: Croatica Chemica Acta
Broj: 3
ISSN: 0011-1643
Volumen: 68
Godina: 1995
Stranice: od 435 do 450
Broj referenci: 33
Jezik: engleski
Sažetak: Novi QSPR prilaz pomoću ortogonaliziranih deskriptora iskorišten je na primjeru fizikalno-kemijskih svostava prirodnih aminokiselina.
Ključne riječi: kvantitativni modeli strukture-svojstava, ortogonalizirani deskriptori, analiza dominatnih komponenata, prirodne aminokiseline, fizikalno kemijska svojstva

Naslov: Modeli strukture-aktivnosti mogu se poboljšati korištenjem ortogonalnih deskriptora

Autori:: Lučić, Bono (184293); Lučić, Bono (184293); Trinajstić, Nenad (50450); Juretić, Davor (19290)

Časopis: J. Chem. Inf. Comp. Sci.
ISSN: 0095-2338
Volumen: 35
Godina: 1995
Stranice: od 532 do 538
Broj referenci: 20
Jezik: engleski
Sažetak: Opisan je način kako se mogu napraviti bolji kvantitativni modeli strukture-aktivnosti uz pomoć ortogonaliziranih deskriptora.
Ključne riječi: Modeli strukture-aktivnosti, ortogonalizirani deskriptori, oktani, točke vrenja

Naslov: Skala beta-sklonosti za predviđanje strukture-aktivnosti u membranskim proteinima

Autori:: Juretić, Davor (19290); Pešić, Roko

Časopis: Croatica Chemica Acta
Broj: 1
ISSN: 0011-1643
Volumen: 68
Godina: 1995
Stranice: od 215 do 232
Broj referenci: 56
Jezik: engleski
Sažetak: Položaj i identitet aminokiselina u primarnoj strukturi membranskih proteina, koje su važne za transport iona, može se predvidjeti sa zadovoljavajučom točnošću pomoću sklonosnih funkcija. Sklonosne funkcije smo izračunali koristeći beta-sklonosti za strukturu porina i naš PREF-SPLIT programski paket napisan u FORTRANU.
Ključne riječi: Sklonosne funkcije, membranski proteini, porini, sklonosti za beta-strukturu, transport iona, predviđanje

Naslov: Kontrola prigušenih oscilacija mitohondrijsih procesa opažena u prisustvu magainina

Autori:: Juretić, Davor (19290)

Časopis: Periodicum Biologorum
ISSN: 0031-5362
Volumen: 93
Godina: 1991
Stranice: od 277 do 278
Broj referenci: 8
Jezik: engleski
Sažetak: Gušene oscilacije u potencijalu membrane, gradijentu protona i volumenu mitohondrija izoliranih iz jetre pacova opažene su u prisustvu sukcinata, kisika, valinomicina i peptida PGLa iz porodice magainina.
Ključne riječi: oscilacije, potencijal membrane, volumen mitohondrije, sukcinat, valinomicin, magainin, PGLa, kisik

Naslov: Membranski pretvarači slobodne energije: koristi od nepotpune povezanosti i nelinearnosti

Autori:: Juretić, Davor (19290)

Časopis: Acta Pharmaceutica
Broj: 4
ISSN: 1330-0075
Volumen: 42
Godina: 1992
Stranice: od 373 do 376
Broj referenci: 14
Jezik: engleski
Sažetak: Ne-linearni način pretvaranja slobodne energije uz slabiju povezanost procesa je efikasniji način transdukcije energije nego u linearnom Onsagerovom području. Jedan ne-linearni model za pretvaranje slobodne energije koje vrši membranski protein citokrom c oksidaza pokazao je da je ne-linearnost i prisutnost klizanja u procesu izbacivanja protona iz mitohondrije pogodnija za kontrolu metabolizma neko linearni način rada te protonske crpke.

Naslov: Sekundarna struktura membranskih proteina: predviđanje sa sklonosnim funkcijama topljivih proteina

Autori:: Juretić, Davor (19290)

Časopis: Croatica Chemica Acta
Broj: 4
ISSN: 0011-1643
Volumen: 65
Godina: 1992
Stranice: od 921 do 932
Broj referenci: 50
Jezik: engleski
Sažetak: Konformacijske funkcije sklonosti dobivene su statističkom analizom baze podataka struktura topljivih proteina. Izgrađen je algoritam koji predviđa sekundarnu strukturu uspoređivanjem sklonosti. Za proučavani skup od 14 membranskih polipeptida točnost predviđanja iznosi 78% u modelu sa 3 stanja i 90% za aminokiselinske ostatke koji imaju konformaciju alfa-uzvojnice.

Naslov: Sekundarna struktura proteina i pridružene skale hidrofobnosti aminokiselina

Autori:: Juretić, Davor (19290); Trinajstić, Nenad (50450); Lučić, Bono (184293)

Časopis: Journal of Mathematical Chemistry
ISSN: 0259-9791
Volumen: 14
Godina: 1993
Stranice: od 35 do 45
Broj referenci: 69
Jezik: engleski
Sažetak: Izgrađena je hijerarhiju algoritama za predviđanje sekundarne strukture membranskih proteina u verziji metode kliznog prozora koja koristi sklonosne funkcije. Ovaj programski paket je omogućio da se usporedi uspjeh velikog broja raznih ljestvica hidrofobnosti 20 prirodnih aminokiselina u predviđanju sekundarne strukture membranskih proteina.
Ključne riječi: ljestvice hidrofobnosti, predviđanje sekundarne strukture, membranski proteini, metoda sklonosnih funkcija, metoda kliznog prozora

Naslov: Predviđanje sekundarne strukture membranskih proteina: metoda sklonosnih funkcija za nalaženje optimalnih konformacijskih parametara

Autori:: Juretić, Davor (19290); Lučić, Bono (184293); Trinajstić, Nenad (50450)

Časopis: Croatica Chemica Acta
Broj: 1
ISSN: 0011-1643
Volumen: 66
Godina: 1993
Stranice: od 201 do 208
Broj referenci: 40
Jezik: engleski
Sažetak: Razvijena je automatska iterativna metoda za predviđanje sekundarne strukture membranskih proteina korištenjem sklonosnih funkcija.
Ključne riječi: Membranski proteini, sklonosne funkcije, sekundarna struktura, optimalni parametri

Naslov: Sklonosne funkcije za predviđanje uzvojnica u membranskim proteinima

Autori:: Juretić, Davor (19290); Lee, Byungkook; Trinajstić, Nenad (50450); Williams, Robert W.

Časopis: Biopolymers
ISSN: 0006-3525
Volumen: 33
Godina: 1993
Stranice: od 255 do 273
Broj referenci: 68
Jezik: engleski
Sažetak: Opisan je skup FORTRAN programa PREF za proračun sklonosnih funkcija iz zadane datoteke proteina poznate strukture. U radu se pokazuje da su naši programi korisni u predviđanju sekundarne strukture integralnih membranskih proteina.
Ključne riječi: Sklonosne funkcije, predviđanje uzvojnica, membranski proteini

Naslov: Sklonosne funkcije na osnovu hidrofobnosti aminokiselina i predviđanje sekundarne strukture za membranske proteine

Autori:: Juretić, Davor (19290)

Časopis: Acta Pharmaceutica
Broj: 3
ISSN: 1330-0075
Volumen: 43
Godina: 1993
Stranice: od 223 do 226
Broj referenci: 10
Jezik: engleski
Sažetak: Nedavno razvijena metoda konformacijskih funkcija sklonosti koristi se u ovom radu za predviđanje sekundarne strukture 23 membranska polipeptida. Istaknuta je važnost pravilnog izbora ljestvice statističkih ili fizikalnih svojstava (poput hidrofobnosti) 20 prirodnih aminokiselina, kao i važnost izbora skupa proteina za treniranje ove metode.
Ključne riječi: membranski proteini, sklonosne funkcije, predviđanje sekundarne strukture, analiza hidrofobnosti


Ministarstvo znanosti i tehnologije	Engleski jezik	Svibor početna stranica	Abecedni popis	Složeno po šifri projekta	Složeno po ustanovi projekta	Pretraživanje	Pomoć

Informacije: svibor@znanost.hr