SVIBOR - Projekt broj: 1-03-171

MINISTARSTVO ZNANOSTI I TEHNOLOGIJE

Strossmayerov trg 4, HR - 10000 ZAGREB
tel.: (01) 459 44 44, faks: (01) 459 44 69
E-mail: ured@znanost.hr

SVIBOR - Prikupljanje podataka o projektima u RH

Šifra projekta: 1-03-171

PREDVIĐANJE STRUKTURE I DJELOVANJA MEMBRANSKIH POLIPEPTIDA

Glavni istraživač: JURETIĆ, DAVOR (19290)

Suradnici

Tip istraživanja: temeljno
Trajanje od: 01.01.91. do 31.12.96.

Ukupno radova na projektu: 30
Radovi na projektu citirani u Current Contents: 15

Naziv ustanove: Fakultet prirodoslovno matematičkih znanosti i odgojnih područja, Split (177)
Odjel/Zavod: Zavod za fiziku, Fakultet prirodoslovno-matematičkih znanosti i odgojnih područja u Splitu, Sveučilište u Splitu
Adresa: N. Tesle 12
Grad: 21000 - Split, Hrvatska

Komunikacija: Telefon: 385 (0)21587133; Telefon: 385 (0)21591438; Telefon: 385 (0)21587009; teleFaks: 385 (0)21362431; E-mail: juretic"mapmf.pmfst.hr

Sažetak: Razvit će se nekoliko teorijskih metoda za predvidjanje strukture i djelovanja peptida i proteina vezanih uz membrane. Uvođenje sklonosnih funkcija omogućit će nam da se poboljša točnost predviđanja sekundarne strukture integralnih membranskih proteina. Sklonosne funkcije će biti uvedene u naš algoritam za predviđanje sekundarne strukture proteina kao funkcije geometrijskih, statističkih ili fizikalnih parametara važnih za proces umotavanja proteina. U daljnjem radu odredit će se optimalni konformacijski parametri za prepoznavanje najčešćih motiva umotavanja u proteinima i optimalni parametri za određivanje točnosti predviđanja sekundarne strukture. Nastavit će se rad na eksperimentalnim dokazima da grupa novo otkrivenih membranski-aktivnih peptida s antibiotičkim djelovanjem, nazvanih magainini, djeluje reverzibilno, kooperativno i sinergetski u smanjivanju elektrokemijskog potencijala umjetnih organela sa membranskim proteinom citokrom c oksidazom. Model rada citokrom c oksidaze u nelinearnom području pumpanja protona i općenito ispitivanje nelinearnih pretvarača slobodne energije biti će još jedan teorijski doprinos rada na ovom projektu.

Ključne riječi: membranski proteini, membranski-aktivni peptidi, sekundarna struktura, sklonosne funkcije, točnost predviđanja strukture, konformacijski parametri, predviđanje sekundarne strukture, alfa-uzvojnice, magainini, citokrom c oksidaza, protonske crpke, parametri klizanja, stupanj povezanosti procesa, efikasnost pohranjivanja slobodne energije, nelinearni procesi, kontrola metaboličkih procesa, transmembranski potencijal

Ciljevi istraživanja: Razvit će se nekoliko teorijskih metoda za predviđanje strukture i djelovanja petida i proteina vezanih uz membraneme. Očekivani doprinos je bolje razumijevanje procesa umotavanja membranskih proteina i djelovanja takvih proteina i peptida u njihovoj membranskoj okolini. U toku rada na projektu razvoj metode sklonosnih funkcija u našem laboratoriju omogućio je da dobijemo međunarodno kompetitivne rezultate za predviđanje sekundarne strukture membranskih proteina. Prvi cilj rada u narednom razdoblju biti će standardiziranje i usavršavanje spomenute metode kako bi biokemijski laboratoriji u svijetu mogli rutinski koristiti naš servis za predviđanje topologije membranskih polipeptida. Taj cilj podrazumjeva nalaženje optimalnih konformacijskih parametara za dvadeset prirodnih aminokiselina, nalaženje optimalnih parametara za izračavanje točnosti predviđanja, i izbor najpogodnije baze podataka proteina poznate strukture za treniranje algoritama. Posebna pažnja posvetit se predviđanju strukture i djelovanja membranski-aktivnih peptida, kao što su novo otkriveni antibiotici: magainini. Tražit će se korelacije između strukture i fizikalnih svojstava peptida u membranskoj okolini, te između strukture i djelovanja peptida. Konstruirat će se nelinearni modeli za rad ključne protonske crpke u procesu respiracije, integralnog membranskog proteina citokrom c oksidaze.

SURADNJA - USTANOVE

Naziv ustanove: Institut "Ruđer Bošković"
Tip ustanove: Sveučilište/Fakultet
Tip suradnje: Zajedničko objavljivanje znanstvenih radova
Grad: 10000 - Zagreb, Hrvatska

OSTALA POSTIGNUĆA

Naziv: Paketi FORTRAN programa PREF 2.0 i PREF 3.0 (PREF-SPLIT)
Tip proizvoda: Ostalo
Autor(i): Davor Juretić, Bono Lučić
Naziv: CROPROT datoteka od oko 200 integralnih membranskih proteina
Tip proizvoda: Ostalo
Autor(i): Davor Juretić, Bono Lučić
Naziv: JURAAS datoteka od oko 100 skala svojstava aminokiselina
Tip proizvoda: Ostalo
Autor(i): Davor Juretić

Ostali podaci o projektu.


Ministarstvo znanosti i tehnologije	Engleski jezik	Svibor početna stranica	Abecedni popis	Složeno po šifri projekta	Složeno po ustanovi projekta	Pretraživanje	Pomoć

Datum zadnje promjene: 14.07.95
Informacije: svibor@znanost.hr