Strossmayerov trg 4, HR - 10000 ZAGREB
tel.: (01) 459 44 44, faks: (01) 459 44 69
E-mail: ured@znanost.hr
SVIBOR - Prikupljanje podataka o projektima u RH
Šifra projekta: 1-08-070
AMINOACIL-tRNA-SINTETAZE: STRUKTURA GENA I FUNKCIJA PROTEINA
Glavni istraživač
: KUĆAN, ŽELJKO (24372) Suradnici
NARANĐA, TATJANA (109286)
PODRAVEC, MARIJA (37751)
RUBELJ, IVICA (108443)
WEYGAND-ĐURAŠEVIĆ, IVANA (57696)
LANDEKA, IRENA (900209)
GRUIĆ, ITA (900661)
ROKOV, JASMINA (900834)
Tip istraživanja: temeljno Trajanje od: 01.01.91. do 31.12.93. Ukupno radova na projektu: 44
Radovi na projektu citirani u Current Contents: 15
Naziv ustanove: Prirodoslovno-matematički fakultet, Prirodoslovni odjeli, Zagreb (119) Odjel/Zavod: Kemijski odjel Zavod za organsku kemiju i biokemiju Adresa: Strossmayerov trg 14 Grad: 10000 - Zagreb, Hrvatska
Komunikacija
Telefon: 385 (01) 434-769, ¦. Ku†an
teleFaks: 385 (01) 432-526, ¦. Ku†an
Telefon: 385 (01) 4561-197, I. Weygand
teleFaks: 385 (01) 425-497, I. Weygand
E-mail: Weygand@olimp.irb.hr
Sažetak: Cilj ovog projekta je da se kombinacijom biokemijskih, molekularno-bioloških i genetičkih metoda dođe do novih saznanja o molekularnim mehanizmima međusobnog prepoznavanja molekula transfer-ribonukleinskih kiselina (tRNA) i enzima aminoacil-tRNA sintetaza. To prepoznavanje predstavlja ključni, ali još uvijek nerazjašnjen korak u prijenosu genetičke informacije (tzv. translacija genetičke poruke). Studira se dva para tRNA/sintetaza: tirozinski i serinski, i to iz kvasca Saccharomyces cerevisiae. Ovi enzimi pripadaju dvjema različitim grupama sintetaza, koje karakterizira različiti način interakcije s pripadnim tRNA. Rad uključuje kloniranje, sekvenciranje i ekspresiju gena, mutagenezu in vivo i in vitro, selekciju i analizu mutanata, te, u za to pogodnim slučajevima, određivanje biokemijskih i biofizičkih parametara u reakciji aminoaciliranja odnosno stvaranja kompleksa tRNA/enzim. Na taj se način nadamo identificirati dijelove molekula ovih dvaju enzima, koji su odgovorni za njihovu specifičnost, tj. za odabir samo jednog od dvadeset tipova molekula tRNA, koliko ih ima u svakoj živoj stanici.
Ciljevi istraživanja: Cilj naših istraživanja je upoznavanje
molekularnih interakcija seril-tRNA sintetaze (SerRS) i tirozil-tRNA
sintetaze (TyrRS) iz kvasca Saccharomyces cerevisiae s njihovim
supstratima: ATP, serinom, odnosno tirozinom, kao i pripadnim molekulama
tRNA, te eventualno utvrđivanje funkcija onih dijelova enzimskih molekula,
koji nisu izravno uključeni u navedene interakcije. Serinski i tirozinski
sistem su odabrani iz više razloga: (1) Ovi enzimi pripadaju različitim
klasama sintetaza, pa možemo očekivati posve drugačije i međusobno
različite tipove interakcija tih enzima s njihovim supstratima; (2)
Poznate su kristalne strukture obaju enzima iz prokariotskih izvora, što
omogućuje interesantnu usporedbu s eukariotskim enzimima odnosno njihovim
genima; (3) Radi se o enzimima s kojima imamo dugogodišnje iskustvo, počam
od prvog potpunog pročišćavanja tirozil-tRNA sintetaze iz haploidnog
kvasca (Ž.Kućan&R.Chambers,J.Biochem.73(1973)811), pa do kloniranja SES1
gena koji kodira za seril-tRNA sintetazu (I.Weygand-Đurašević et
al.,Nucleic Acids Res. 15(1987)1887. Pored već uhodanog postupka izolacije
specifičnih molekula tRNA klasičnim kromatografskim metodama, cilj nam je
konstruirati različite sintetske gene za transfer ribonukleinske od
interesa, i transkribirati ih in vitro. To bi nam omogućilo jednostavno
uvođenje mutacija u najkompleksniji supstrat aminoacil-tRNA sintetaza, te
studj važnosti svakog pojedinog nukleotida u reakciji aminoaciliranja.
SURADNJA - PROJEKTI
Naziv projekta
: PA-91-77 FIRCA Transfer RNA Recognition by Class
II Synthetases Naziv ustanove: Yale University Grad: 06511 - New Haven, CT, USA
Naziv projekta
: GE/GLO/90/004 Protein engineering of
aminoacyl-tRNA synthetases Naziv ustanove: Faculty of Medicine , University of Chile Grad: 7 - Santiago, Chile
SURADNJA - USTANOVE
Naziv ustanove
: Institut de Biologie Moleculaire et Cellulaire
C.N.R.S. Tip ustanove: Sveučilište/Fakultet Tip suradnje: Povremena razmjena stručnjaka Grad: 67084 - Strasbourg, Francuska
Naziv ustanove
: EMBL Grenoble Outstation Tip ustanove: Sveučilište/Fakultet Tip suradnje: Povremena razmjena stručnjaka Grad: 38042 - Grenoble, Francuska
Naziv ustanove
: Institut Ruđer Bošković Tip ustanove: Sveučilište/Fakultet Tip suradnje: Zajednički projekt Grad: 10000 - Zagreb, Hrvatska
Naziv ustanove
: Institut fur Physiolgische Chemie, Universitat
Bonn Tip ustanove: Sveučilište/Fakultet Tip suradnje: Sustavna razmjena informacija Grad: Bonn, Njemačka Ostali podaci o projektu.